Sam Fisher è nuovamente tornato in azione e questa volta deve affrontare un nemico che non aveva mai affrontato prima. Per fermare un devastante progetto di attacco agli Stati Uniti, deve infiltrarsi in un gruppo di terroristi e distruggerlo dal suo interno. Per la prima volta nella serie Sprinter Cell, i giocatori proveranno tutta la tensione derivante dal dover fare scelte decisive imposte dal ruolo di agente "doppio". Infiltrati nelle basi americane di un'organizzazione terroristica e valuta con molta attenzione le conseguenze delle tue azioni. Se elimini troppi agenti nemici, perderai la tua copertura, se esiti anche solo per un attimo milioni di civili innocenti potrebbero essere uccisi. Fai tutto il possibile per completare la tua missione e come sempre Sam Fisher deve uscirne vivo…
Dopo gli eventi di Mexico City, i ribelli Messicani continuano ad insediarsi nei territori circostanti il confine americano. Minacciano di invadere il suolo americano e di impossessarsi di un potente arsenale di armi nel Canale di Panama Hai meno di 72 ore per fermarli.
Nel 2016 un attacco terroristico nucleare in Arabia Saudita uccide sei milioni di persone e paralizza la fornitura di petrolio dal Medio Oriente, gettando il mondo in una crisi energetica senza precedenti. L'anno successivo, gli Stati Uniti d'America e l'Unione Europea firmano uno storico trattato SLAMS (Space Land-Air Missile Shield), uno scudo spaziale in grado di neutralizzare missili nucleari in volo. Incoraggiati dal grande successo dei test a salve, gli Stati Uniti e l'Unione Europea dichiarano "la fine della guerra nucleare strategica", e il mondo celebra una nuova era di pace. La militarizzazione dello spazio raggiunge il suo picco nel 2020, quando gli Stati Uniti rivelano l'intenzione di voler lanciare la stazione spaziale Freedom Star, nel tentativo di riconquistare la sua posizione di superpotenza mondiale.
L'era degli stati-nazione volge al termine e la regolamentazione bellica evolve rapidamente. Un numero sempre maggiore di nazioni diventa dipendente dalle Compagnie Private Militari (PMCs) un'élite di mercenari con una concezione piuttosto labile della legge. Gli Accordi di Reykjavik legittimano ulteriormente la loro esistenza autorizzando il loro intervento in ogni aspetto delle operazioni militari.
Giunto in una terra di mito e leggenda, il Principe di Persia si ritrova coinvolto in un’epica battaglia tra le forze primordiali della luce e dell’oscurità. Purtroppo assiste alla distruzione del leggendario Albero della Vita – un’azione che minaccia di far piombare il mondo nell’oscurità eterna. Subito dopo la distruzione dell’albero, incontra una giovane donna misteriosa di nome Elika, che afferma di essere una guardiana della terra. Questi due eroi uniranno le loro forze nel tentativo di fermare l’ascesa di un’antica e malvagia divinità, conosciuta come Ahriman.
