ALLA RICERCA DELLA GREAT LEGACY
Mega Man Legends 2 è ambientato in un futuro piuttosto lontano su una Terra ricoperta dalle acque ormai quasi per intero. Grazie alle sue spiccate capacità di adattamento, il genere umano è riuscito a sopravvivere rimanendo "arroccato" sugli ultimi baluardi rimasti asciutti degli antichi continenti, ma un problema ancor più grande si sta affacciando all'orizzonte. Infatti, ormai dipendente dalle navi volanti, l'intera specie umana rischia di rimanere senza energia dal momento che i "rifrattori", la sola fonte naturale di energia disponibile sul pianeta in grado di alimentare le macchine, stanno divenendo sempre più rari. La sola speranza rimasta è ritrovare la misteriosa Great Legacy, una fonte di energia alternativa ed inesauribile, di cui parlano alcune leggende. Gli addetti al recupero dei rifrattori sono i Digger (o "scavatori"), una sorta di mercenari a cui è affidato il compito di avventurarsi fra le antiche rovine e di riportare alla luce i preziosissimi cristalli. Fra questi temerari avventurieri c'è Mega Man che, sempre accompagnato dalla sua amica (nonché meccanico personale!) Roll Casket, gira il mondo nella speranza di ritrovare i genitori della sua compagna di avventure. Il destino però ha molte sorprese in serbo per il giovane cyborg e sulla sua strada ben presto comparirà il miliardario Von Muller che, preoccupato per il destino del pianeta, lo ingaggerà per una pericolosa missione esplorativa nel Forbidden Place (un luogo battuto incessantemente dalla tempesta) alla ricerca della Great Legacy