Anno 2009. Le tensioni politiche internazionali sono a un punto di rottura quando un aereo di linea in volo su una rotta commerciale nei cieli dell'Europa orientale viene abbattuto da un missile americano. Non ci sono sopravvissuti. Il governo americano rivendica la propria innocenza e spedisce in missione l'agente Michael Thorton perché assicuri i responsabili alla giustizia.
In Alpha Protocol avrai il controllo totale sullo sviluppo delle capacità di Thorton e sulle sue interazioni con gli altri personaggi. Combattimento ravvicinato, uso delle armi, competenze ingegneristiche e arti seduttive sono solo alcune delle abilità che puoi apprendere. In Alpha Protocol la tua arma più utile sarà la possibilità di scegliere.
Siamo nell'anno 1935 EC in un continente di fantasia che, per combinazione, si chiama Europa (con questa sintassi anche in Inglese e in Giapponese). La popolazione è straziata dalla seconda guerra europea, che vede fronteggiarsi da una parte l'Impero Esteuropeo e dall'altra la Federazione di stati dell'Ovest, entrambi interessati ad impossessarsi delle altrui riserve di Ragnite, un minerale dalle incredibili proprietà utilizzato sia come carburante, sia come curativo, sia come arma. Nella frontiera settentrionale sta il pacifico principato di Gallia, e nella città di Bruhl vive il giovane entomologo Welkin Gunther: quando la città sarà attaccata dall'Impero, il ragazzo non avrà altra scelta se non quella di imbracciare il fucile e unirsi alla resistenza, fino a divenire Tenente Carrista volontario della milizia di Gallia.
