La Terra è cambiata. Sono passati vent'anni da quando i leader mondiali hanno firmato una resa senza condizioni con le forze aliene. Gli XCOM, l'ultima linea di difesa del pianeta, sono stati decimate e dispersi. Ora gli alieni governano la Terra e costruiscono scintillanti città che promettono un futuro luminoso per la nostra specie. Sotto la superficie, però, si nasconde un sinistro piano e una brutale repressione di chi si oppone al nuovo ordine.
Solo chi vive ai confini della società ha un barlume di libertà. È qui che una forza si assembla nuovamente per difendere l'umanità. In costante fuga, le truppe rimaste degli XCOM devono trovare un modo per risorgere dalle loro ceneri, esponendo la dura verità dietro l'occupazione e spazzando via gli alieni una volta per tutte.
