In The Bot Squad: Puzzles Battles, i giocatori controlleranno alcune unità robotiche impegnate a esplorare i vari livelli per ricercare alcune sfere e proteggere dagli altri robot le sfere già ottenute. Sarà necessario esplorare e superare tutte le mappe piene di trappole, combinando le abilità specifiche del proprio robot, oltre a difendere le proprie sfere contro ondate di voraci nemici, posizionando bot d’attacco o di difesa.