Probabilmente sono l'indirizzamento file e la creazione dei punti di ripristino a occupare spazio di giorno in giorno.
Ti direi come disattivarli, ma fai prima a passare a 7 (non tanto per questo "problema", ma perchè 7 è decisamente meglio di Vista).
EDIT: non avevo letto che avevi risolto
Per l'altro problema, penso che il gioco non riesca a riconoscere più di un tot (in questo caso 2 GB) di RAM perchè è piuttosto vecchio.