Forse uno dei mod più particolare per Half Life. In S&I, sarete messi a difesa di un laboratorio governativo dove gli scienziati lavorano alla ricerca e allo sviluppo di nuove e più potenti armi e items. Naturalmente i vostri avversari faranno lo stesso, quindi oltre che a difendere i vostri, dovrete anche andare alla conquista del laboratorio avversario. Una volta catturati gli scienziati avversari, non li ucciderete, ma li presenterete al manager della vostra base (l'uomo in nero, per intenderci ), che provvederà all'assunzione. In questo modo il vostro laboratorio produrrà in maniera molto più celere le vostre nuove armi, permettendovi quindi di sbaragliare gli avversari.