Un tempo, l'isola di Jabberwock era una delle mete turistiche più popolari, ma ora è disabitata e stranamente ancora incontaminata. Tu e i tuoi compagni di classe della prestigiosa Hope's Peak Academy siete stati portati sull'isola dalla vostra affascinante insegnante per una "gita scolastica romantica da veri piccioncini". Tutti sembrano divertirsi sotto il sole... fin quando Monokuma riprende il suo macabro gioco omicida! Intrappolato in questo paradiso tropicale fra reciproci omicidi, la tua unica speranza di salvezza risiede nel risolvere i misteri dell'isola. Ma fai attenzione, perché la verità potrà essere la tua disperazione...
Danganronpa Another Episode: Ultra Despair Girls è ambientato tra i due capitoli precedenti: Danganronpa: Trigger Happy Havoc e Danganronpa 2: Goodbye Despair.
Si tratta di un action in cui il giocatore deve superare diverse sequenze, alcune con enigmi e puzzle, per riuscire a fuggire da una città infestata da orsetti malefici chiamati Monokumas.
La protagonista del gioco è Komaru Naegi, già vista nel primo capitolo.
