La trama di The Last Guardian segue la storia di un giovane ragazzo in fuga da quello che sembra un gigantesco castello in rovina da cui sembra esservi stato imprigionato da qualcuno. L'avventura è incentrata sul legame tra il ragazzo e un enorme creatura simile ad un grifone di nome Trico.
Inizialmente Trico è incatenato ed ha lance e frecce conficcate nel corpo. Dopo la sua liberazione sarà inizialmente ostile verso il ragazzo, ma durante il corso del gioco, tra i due si svilupperà un grande legame reciproco.
I due cercheranno quindi di evadere insieme dal castello in rovina, superando ostacoli rappresentati dalla stessa pericolante struttura e fuggendo da dei soldati in armatura, probabilmente gli stessi che hanno imprigionato Trico.
In God of War verrà rivelata l'origine delle Spade del Caos, l'invincibile arsenale creato nelle caverne di Ade che Kratos riceve da Ares con l'incarico di adempiere alla sua missione di annientamento.
La storia inizia ad Atene, dove Kratos affronta il mostro a tre teste Idra prima di imbarcarsi in un'avventura sanguinaria su ordine di Atena, desiderosa di arrestare i piani distruttivi di Ares e salvare la propria città dalla sconfitta. Kratos intraprende quindi un viaggio alla ricerca del vaso di Pandora, che conferisce ai mortali la capacità di sconfiggere una divinità.
Il vaso è però custodito nelle profondità del tempio di Pandora, che il titano Crono è costretto a portare sulle spalle dopo esser stato confinato per l'eternità nel deserto delle anime erranti da Zeus. Con il dipanarsi dell'epica trama verranno svelati i misteri che avvolgono la vera origine di Kratos fino al feroce scontro finale con Ares.
In God of War II Kratos perde i propri poteri e sembra essere condannato a una tormentata esistenza nel regno di Ade prima dell'intervento di Gaia, la madre dei Titani, che gli propone un accordo in cambio della sua incolumità: Kratos dovrà aiutare i Titani a catturare le sorelle del fato sull'isola della creazione. In questo modo potrà placare la propria sete di vendetta per le passate ingiustizie e annientare Zeus.
Durante l'insidioso viaggio attraverso terre mitologiche Kratos incontra personaggi leggendari, fra cui l'unicorno fatato Pegaso e i titani Tifone, Prometeo e Atlante.