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Nonostante la quantità di bug sia stata decisamente inferiore a quella di altri giochi, anche Far Cry 4 non manca di alcuni problemi riscontrati sulle differenti versioni del gioco.
In particolare, su PC i giocatori hanno lamentato crash, che stando agli sviluppatori sono legati a dei conflitti che nascono con alcune periferiche. Su PS3 invece ci sono stati diversi problemi su file di salvataggio corrotti. Il problema sembra essere - curiosamente - legato a problemi legati ai salvataggi di Far Cry 3, ma il team è ancora in fase di studio e ricerca.
Infine, un problema riguardante tutte le versioni del gioco è quello del mancato riconoscimento dei codici download dei contenuti aggiuntivi. Anche in questo caso il team di sviluppo sta indagando sul da farsi.
