Ambientato alla fine del 18° secolo, durante la guerra di indipendenza americana, Assassin's Creed III introduce un nuovo eroe, Ratohnhaké: Ton, di origini sia native americane che inglesi. Dopo aver adottato il nome di Connor, il protagonista diventa la nuova voce della giustizia nell'antico conflitto tra Assassini e Templari.
I giocatori assumeranno cosě il ruolo di un Assassino nella guerra per la libertŕ contro la spietata tirannia degli inglesi e vivranno una delle esperienze di combattimento piů realistiche e intense mai apparse nella serie.